Das Ministerium hatte insgesamt sieben Abteilungen, die sich jeweils mit verschiedenen Aspekten der Zaubererwelt befassten. Die Abteilung für magische Strafverfolgung ist die größte, und alle anderen folgten ihr mehr oder weniger (außer der Mysteriumsabteilung). Jeder Abteilung ist einer Ebene des Ministeriums zugeordnet, obwohl die Strafverfolgung nicht nur Ebene zwei hatte, sondern auch die Gerichtssäle der Ebene zehn. Es gibt auch viele kleinere Büros innerhalb der Abteilungen, die Teil eines informellen Rangordnungssystems sind, das auf seiner Größe und der wahrgenommenen Bedeutung durch hochrangige Beamte beruhte, wobei die Versetzung von einer kleineren Abteilung in eine größere und geschäftigere als „Beförderung“ angesehen wird. Die Abteilungen kommunizierten durch "Abteilungsübergreifende Memos" auf blassvioletten Papierfliegern, die selbstständig Ziele anflogen, weil die frühere routinemäßige Verwendung von Eulen für Nachrichten innerhalb des Ministeriums zu einer übermäßigen Verschmutzung durch Eulenkot und gehäutete Federn führte. Wobei hier und dort die Memos auch schon über ein extra für das Ministerium eingerichtete Interne Internet laufen.

EBENE 1: MINISTER FÜR MAGIE UND UNTERSTÜTZUNGSPERSONAL
🢥 Büro des Ministers für Zauberei
🢥 Büro des Beraters des Ministers für Zauberei
🢥 Büro des Leitenden Untersekretärs des Ministers für Zauberei
🢥 Büro des Unterassistenten des Ministers für Zauberei

EBENE 2: ABTEILUNG FÜR MAGSICHE STRAFVERFOLGUNG
🢥 Hauptabteilungen
🢥 🢥 Aurorenbüro
🢥 🢥 Büro für unsachgemäße Verwendung von Magie
🢥 🢥 Zaubergamot-Verwaltungsdienste

🢥 Unterabteilungen
🢥 🢥 Administrative Registrierungsabteilung
🢥 🢥 Abteilung für Rauschmittel
🢥 🢥 Eingreifzauberer und Hexen
🢥 🢥 Untersuchungsabteilung
🢥 🢥 Magische Strafverfolgungspatrouille
🢥 🢥 Hexenbeobachter des Ministeriums für Magie
🢥 🢥 Büro für Missbrauch von Muggelartefakte
🢥 🢥 Amt für die Erkennung und Beschlagnahme gefälschter Abwehrzauber und Schutzgegenstände

EBENE 3: ABTEILUNG FÜR MAGISCHE UNFÄLLE UND KATASTROPHEN
🢥 Magische Unfallumkehr-Kommando
🢥 Vergissmich-Zentrale
🢥 Komitee für muggelgerechte Entschuldigungen
🢥 Muggel-Verbindungsbüro

EBENE 4: ABTEILUNG FÜR DIE REGULIERUNG UND KONTROLLE MAGISCHER GESCHÖPFE
🢥 Tierwesenbehörde
🢥 Zauberwesenbehörde
🢥 Geisterbehörde
🢥 Amt für Desinformation
🢥 Zentauren-Verbindungsbüro
🢥 Goblin-Verbindungsbüro
🢥 Büro für die Umsiedlung von Hauselfen
🢥 Beirat für Schädlinge

EBENE 5: ABTEILUNG FÜR INTERNATIONALE MAGISCHE ZUSAMMENARBEIT
🢥 Internationaler Magischer Handelsstandardausschuss
🢥 Das Internationale Magische Büro für Recht

EBENE 6: ABTEILUNG FÜR MAGISCHES TRANSPORTWESEN
🢥 Behörde für Flohnetzwerke
🢥 Besenregulierungskontrolle
🢥 Portschlüsselbüro
🢥 Appariertestzentrum

EBENE 7: ABTEILUNG FÜR MAGISCHE SPIELE UND SPORTARTEN
🢥 Hauptquartier der britischen und irischen Quidditch-Liga
🢥 Offizieller Gobstones-Club
🢥 Büro für lächerliche Patente

EBENE 8: DAS ATRIUM
🢥 Lobby und Empfangsbereich
🢥 Springbrunnen der magischen Brüder
🢥 Magie-ist-Macht-Denkmal
🢥 Ministerium Munchies
🢥 Sicherheitspult
🢥 Aufzüge
🢥 Magisches Wartungsbüro
🢥 Ausschuss für experimentelle Zauber
🢥 Magische Wartungsabteilung
🢥 Öffentliche Informationsdienste des Zaubereiministeriums
🢥 Abteilung für magische Bildung
🢥 Sehr wichtige Mitglieder der Sektion M.I. Trx.
🢥 Zaubererprüfungsbehörde
🢥 Forschungsausschuss des Zaubereiministeriums
🢥 Entsorgungseinheit für explodierende Bonbons des Zaubereiministeriums
🢥 Auswärtige Angelegenheiten und Sportabteilung

EBENE 9: ABTEILUNG FÜR MYSTERIEN
🢥 Halle der Prophezeiung
🢥 Raum des Todes
🢥 Raum der Gedanken
🢥 Raum der Zeit
🢥 Raum der Sterne
🢥 Raum der Liebe

EBENE 10: GERICHTSSÄLE DES ZAUBERGAMOTS
🢥 Gerichtssaal 01
🢥 Gerichtssaal 02
🢥 Gerichtssaal 03
🢥 Gerichtssaal 04
🢥 Gerichtssaal 05
🢥 Gerichtssaal 06
🢥 Gerichtssaal 07
🢥 Gerichtssaal 08
🢥 Gerichtssaal 09
🢥 Gerichtssaal 10